台当局“行政院”发布新闻稿表示，吴敦义对王清峰的理念表示尊重，但对于台湾目前已判决确定的死刑案件，若要暂缓执行，须有合于规定的理由。吴敦义在与马英九沟通后，接受王清峰请辞。